目前，微通道反應器總體構造可分為兩種：

　　一種是整體結構，這種方式以錯流或逆流熱交換器的形式體現，可在單位體積中進行高通量操作。在整體結構中只能同時進行一種操作步驟，最后由這些相應的裝置連接起來構成復雜的系統。

　　

　　另一種是層狀結構，這類體系由一疊不同功能的模塊構成，在一層模塊中進行一種操作，而在另一層模塊中進行另一種操作。流體在各層模塊中的流動可由智能分流裝置控制對于更高的通量，某些體系通常以并聯方式進行操作。

　　

　　微反應器又可分為氣固相催化微反應器、液液相微反應器、氣液相微反應器和氣液固三相催化微反應器等。

　　

　　微反應器設備根據其主要用途或功能可以細分為微混合器，微換熱器和微反應器。由于其內部的微結構使得微反應器設備具有極大的比表面積，可達攪拌釜比表面積的幾百倍甚至上千倍。微反應器有著很好的傳熱和傳質能力，可以實現物料的瞬間均勻混合和高效的傳熱，因此許多在常規反應器中無法實現的反應都可以微反應器中實現。